La vocation du service de Microbiologie est de donner accès aux techniques de Microbiologie dans les travaux de recherche de l’institut situés à l’interface chimie/biologie. Le service est également ouvert aux personnes extérieures à l’institut (voir le paragraphe Prestations).

Membres du service

Nom

Téléphone

Spécialité

Muriel JOLY – IGE UCA
Responsable scientifique et technique

04-73-40-77-15

Microbiologie – Biologie moléculaire

Mariline THEVENIOT – T UCA

04-73-40-77-15

Microbiologie – Culture cellulaire

Domaines d’applications

  • Microbiologie – Biologie moléculaire – Environnement - Culture cellulaire
Savoir-faire
  • Isolement et identification de microorganismes provenant de différents compartiments de l’environnement

  • Etude de métabolismes bactériens

  • Biodégradation de composés xénobiotiques

  • Production d’enzymes pour la biocatalyse

  • Production de souches mutantes pour un gène d’intérêt

  • Production de métabolites secondaires à intérêt biologique

  • Tests d’activités antimicrobiennes

  • Gestion de la collection de souches microbiennes du laboratoire

Équipements

 
Nom de l’équipement
Marque / Modèles
Postes de Sécurité Microbiologique de classe II (PSM) [x2]
ThermoFisher Scientific / MSC Advantage 0.9 & 1.2
PSM MSC Advantage
PSM MSC Advantage
Incubateurs agités thermostatés et réfrigérés [x3]
Infors / Multitron
Eppendorf / Innova S44R
Infors multiton II
Infors multiton II
 
Innova 44R
Innova 44R
Centrifugeuses haute capacité [x2]
Beckman Coulter / Avanti JXN26 & J26XPI
Centrifugeuse JXN26
Centrifugeuse JXN26
Autoclaves [x2]
Tuttnauer / 5075 ELV
Lequeux
Congélateurs -80°C [x3]
Panasonic / MDF-U500VX
Sanyo / MDF-U500VX
Congélateur SANYO MDF-U500VX
Congélateur SANYO MDF-U500VX
Thermocycleur
BioRad / T100 Cycler
BioRad T100
BioRad T100
Systèmes d’électrophorèse [x2]
EmbiTec / RunOne
Nano-spectrophotomètre
Shimadzu / Biospec nano
BioSpec nano
BioSpec nano
Tensiomètre / mesure d’angle de contact
Apollo Instruments / Contact angle system OCA
Tensiomètre Apollo Instruments
Tensiomètre Apollo Instruments
Désintégrateur de cellules / Sonicateur
Bandelin / GM 3100
System LTD / One shot cell disruptor
Sonicateur
Sonicateur
Microscope optique
Olympus / CH2
Olympus CH2
Olympus CH2
Chambre froide

Souchothèque

 
La souchothèque de l’Institut de Chimie de Clermont-Ferrand est gérée par le service de Microbiologie. Elle regroupe ~1200 souches de bactéries et de levures isolées de l’environnement et identifiées par notre institut. L’une des particularités de notre banque de souches est qu’elle est l’une des seules au monde constituée d’isolats d’eau de nuage (~1100 souches). Ces souches proviennent de nuages échantillonnés au sommet du puy de Dôme, du mont Maïdo (île de la Réunion) ou du mont Cimone (Italie).
Les principaux genres de bactéries et de levures de notre banque de souches sont présentés ci-dessous.
Isolats bactériens dans la souchothèque de l'ICCF
Isolats bactériens dans la souchothèque de l'ICCF
Isolats levures dans la souchothèque de l'ICCF
Isolats levures dans la souchothèque de l'ICCF
En complément des souches isolées de l’environnement, nous conservons en cryotubes environ 450 souches bactériennes recombinantes utilisées pour la production d’enzymes pour la biocatalyse. Près de la moitié d’entre elles sont issues d’une collaboration avec le Génoscope (Evry).

Prestations

 
Les prestations académiques sont effectuées dans le cadre de collaborations scientifiques.
Des prestations sont également possibles avec les entreprises. Il peut s’agir de transfert de souches d’intérêt biotechnologique, de la réalisation de tests microbiologiques ou de mesure de tensions de surface par exemple. L’accès à certains appareils du service peut également être mis en place.
Contact : Muriel JOLY